2017年，東蓮覺苑獲香港特區政府刊憲列為法定古蹟。整座苑舍由建築師馮駿先生設計，並由靄亭法師指導，讓建築細節能表達佛教法義。馮氏曾於美國及歐洲考察建築，1933年赴英國倫敦攻讀建築繪圖碩士，其後回港從事設計工作。

東蓮覺苑位於山腰，坐南朝北，依山而建。受地勢限制，不如傳統佛寺在縱軸線上設有內庭分隔，但馮氏卻保留了中式佛寺的傳統空間格局：由山門、前殿、大雄寶殿及寶塔沿中軸線層層遞升排列。獨特的三角形地皮令建築平面呈箭鏃形，也像越洋渡海的樓船，寓意承載眾生到彼岸的般若船，呼應大乘佛教普度眾生的精神。

馮氏將中西建築元素融匯，體現1930年代盛行的折衷主義建築風格（Eclecticism in architecture）。屋頂結合歇山頂、重檐歇山頂與十字脊頂；正脊與屋頂飾有二龍爭珠、鴟吻、垂獸等陶塑；出檐下設裝飾性斗栱，山牆懸魚點綴；主要結構以混凝土建造，配以意大利階磚與彩色玻璃窗，呈現莊嚴華美的格局。

本苑落成初期，韋馱殿兩側空間為寶覺義學課室；隨時代轉變，後來改作客堂與活動室，現已成為展覽場地，見證了空間功能隨需求而調整的歷程。

本苑依循「歷史建築・修舊如舊」原則，自2015年啟動保育計劃，深信護持道場即是護持佛法。保育範疇涵蓋有形建築與無形文化價值，包括：聘請保育顧問、成立檔案部及工程部、制定檔案管理及建築保護計劃、開展歷史研究與建築評估等。復修期間亦分階段開放導賞及舉行分享會，讓公眾體驗佛教建築的美學與精神。

除了建築的維護，本苑同樣重視文物與文獻檔案的保存。2016年，本苑成立「檔案部」，以「檔案文獻・永續使命」為宗旨，負責收錄、管理與保存與本苑相關的檔案文物。這些工作不僅能保存寶貴的歷史文化，也有助大眾了解香港佛教的發展，並延續佛法智慧。

本苑圖書館亦收藏大量佛教出版物。過去，本苑曾是佛教書刊流通的重要地點，這些珍貴典籍見證了本苑透過出版弘法的歷史。文物與文獻因此成為承載本苑乃至香港佛教歷史的重要載體，整理與保育工作正是本苑護持佛教的重要方式。
2021年，本苑推出「口述歷史計劃」，透過專業培訓、訪談與資料整理，培養口述歷史訪問員，從不同角度認識東蓮覺苑及香港佛教的發展，並建立珍貴的歷史資料庫。

欣逢東蓮覺苑建苑九十周年，本苑更特別推出檔案部網站，內容包括：發展歷程、珍藏檔案、專題展覽與人物專訪，期望讓更多人認識並珍惜這份歷史與文化。